美国加州大学旧金山分校Alexander Marson等研究人员合作发现，碱基编辑诱变绘制出调整人类T细胞功能的等位基因图谱。相关论文于近日在线发表于国际学术期刊《自然》。
研究人员开发了一个大规模碱基编辑诱变平台，目的是精确定位编码可调节原代人类T细胞活化反应的氨基酸残基的核苷酸。研究人员生成了一个包含约117000个单向导RNA分子的文库，将碱基编辑靶向385个与T细胞功能有关的基因的蛋白质编码位点，并系统地鉴定了调节T细胞活化和细胞因子产生的蛋白质结构域和特定氨基酸残基。研究人员发现了广泛的等位基因，包括编码PIK3CD、VAV1、LCP2、PLCG1和DGKZ等蛋白中关键残基的变体，其中既有功能增益突变，也有功能丧失突变。研究人员验证了许多等位基因的功能效应，并进一步证明碱基编辑突变可以正反两方面调节T细胞的细胞毒性功能。
最后，通过使用对原间隔基序要求宽松的碱基编辑器（NG对NGG）进行更高分辨率的筛选，研究人员发现了可用于调整T细胞功能的特定结构域和蛋白质-蛋白质相互作用位点。因此，原代免疫细胞中的碱基编辑筛选提供了生化见解，并有可能加速免疫疗法的设计。
研究人员表示，CRISPR筛选技术是发现控制T细胞功能的基因的有力工具，并为免疫疗法提名了候选靶标。然而，还需要新的方法来探测关键基因中的特定核苷酸序列。在原代人类T细胞中进行系统突变可以发现调整特定表型的等位基因。DNA碱基编辑器是高效引入靶向突变的强大工具。
